通过以上五点，可以看出《九层妖塔》是一部标准的好莱坞式娱乐片；而对于一部好莱坞式娱乐片来说，这五点都是加分点。除此之外只要有一个好故事，就一定会是一部商业上非常成功的作品。
首先是是叙事节奏问题。通常一部好莱坞娱乐片采用1:2:1的情节分配比例，引子要精练地交代背景、调动情绪，中间用充足的时间推进情节、刻画人物，高潮及尾声一气呵成。然而本片却以地域（昆仑腹地、北京、西北石油小镇）为限形成了1:1:1的分配比例。别看似乎差异不大，但这样却容易造成观众的疲劳，因为观众不知道在哪里可以有所期待，在哪里可以歇一歇。拿本片的115分钟来说，开头的1979年的昆仑腹地占去了大约40分钟，讲述了胡八一参加的探险队如何历尽艰险、损失惨重，胡八一、连长、杨教授、杨萍死人坠崖后离奇生还见到九层妖塔，连长牺牲，几人又从里面逃出、坠湖，杨教授失踪、杨萍被水怪掠走，胡八一幸存回到驻地，简直是一部小探险片了。接下来是1982年，胡八一回到北京，在王馆长的华夏图书馆里工作，逐渐接触到了九层妖塔属于外星人后裔鬼族的事实，并明白当年杨教授早就知道并且有意让他和杨萍开启妖塔。与此同时杨教授和杨萍都离奇现身，而杨萍也像是换了一个人。这一段几乎都是文戏。等到1985年胡八一随“中国神盾局”749局前往西北石油小镇调查杨教授再次失踪事件以及此地发生的怪兽袭人事件时，电影只剩下45分钟了。随后他们不但要一边跟怪兽打斗，还要一边把整件事情的来龙去脉解释清楚。
其次是情节发展与人物动机问题。应该说，在昆仑腹地部分的情节，还是很正常的，甚至可以说是很吸引人的。不幸的是，等胡八一回到北京，整个电影的情节就开始滑向未知的深渊，让人怀疑这是不是胡八一在昆仑山里撞坏了脑袋所做的一场梦。
王馆长告诉胡八一他是鬼族死敌羿王后裔，还带他来到王子墓，到处是幽灵一样的守卫。随着Shirley杨的出现，王馆长告诉胡八一怪兽到处苏醒，紧接着一群幽灵化的怪兽就冲了进来跟馆长和幽灵守卫混战，然后王馆长便让胡八一走掉了……完全不知道这些怪兽是哪来的，为什么除了王馆长大家都跟幽灵一样。给神秘现身的杨萍起名为Shirley杨，也不过是749局局长没头没脑的一句话。为什么要改名？她只不过是变得跟以前不太一样了，就有必要改名？就为了跟原著一致么？其次，一个国家秘密机关的公务员，上来就拿英文命名，是不是不太专业了一点？等到了石油小镇，胡八一居然又发现了一个王子墓——那王馆长那个是咋回事？他还发现杨萍是被鬼族附体变成了Shirley杨，带着怪兽向749局发动了攻击。鬼族希望胡八一来开启妖塔，但他要求鬼族不能伤害749局的人——这时候不是很标准的交易环节吗？鬼族应该以749局的人相要挟，可他们怎么做呢？把胡八一放了回去，还要求他不能伤害Shirley杨，否则就如何如何。理解不能。
第三是闪回混乱。对于石油小镇是何时遇袭的，影片交代得自相矛盾。根据电影情节，胡八一应当是在北京待了三年，从82年待到85年，这之后镜头转到石油小镇遇袭，并且在转向小镇时，底下打出的字幕貌似也是1985年。然而在随后递交到749局的有关石油小镇遇袭的内参上，显示的时间却是“一九八二年”。这之后杨教授外出调查时失踪。等胡八一与749局的人来到遇袭后的石油小镇时，也是1985年。所以石油小镇究竟是哪一年遇袭的成为了一个谜。
等电影终于死乞白赖地拖到了结尾，被解除附体的杨萍终于临死前和胡八一见上了一面。我们也终于知道她也是鬼族后裔，有起死回生的能力，只不过在昆仑腹地给其实已经遇难的胡八一等人用尽了。而杨教授希望开启妖塔，是因为这样就可以解除鬼族人四五十岁必自燃的诅咒。
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